Henrike Hahn wurde im Mai 2019 als bayerische Spitzenkandidatin in das Europaparlament gewählt. Dort ist sie Vollmitglied im Ausschuss für Industrie, Forschung und Energie sowie stellvertretendes Mitglied des Wirtschafts- und Währungsausschusses und des Haushaltsausschusses. Sie ist außerdem mitwirkungsberechtigtes Mitglied im Europa-Ausschuss des Deutschen Bundestages und stellvertretende Delegationsleiterin der Europagruppe von BÜNDNIS 90/DIE GRÜNEN. Als industriepolitische Sprecherin und Leiterin der Kampagne für grüne Industriepolitik der grünen Europafraktion setzt sie sich vor allem für die ökologisch-soziale Transformation der Wirtschaft in Europa und in Bayern ein.